Задачи и функции отделов управления размещены по следующим ссылкам.
Межрайонный отдел экологического надзора (МОЭН) - Организация и осуществление государственного экологического надзора на объектах хозяйственной и иной деятельности независимо от их организационно-правовых форм и форм собственности, находящихся на территории Алтайского края, за исключением объектов, подлежащих федеральному государственному экологическому надзору.
Отдел водных ресурсов - Участие в осуществлении мер по охране водных объектов или их частей, находящихся в федеральной собственности и расположенных на территории края.
Отдел природных ресурсов - Взаимодействует с федеральными органами исполнительной власти в сфере изучения, использования, воспроизводства, охраны природных ресурсов и окружающей среды.
Отдел экологической экспертизы и нормирования - Обеспечение функционирования государственной экологической экспертизы регионального уровня и государственной системы нормирования в сфере природопользования с целью предотвращения и снижения негативного воздействия на окружающую среду и обеспечения устойчивого социально-экономического развития региона через внедрение в хозяйственную практику рационального природопользования.
